Вот, кстати, версия для чего Скорсезе все же использовал такую фразу в конце... чтобы придать двойственность сюжету, "а вдруг и взаправду правительство занимается опытами по контролю над сознанием людей"

Я думаю, все проще: эта фраза по сути аналогична волчку, на вращении которого заканчивается фильм "Начало" (Inception).
В "Начале" - относительно места действия (сон/реальность), в "Острове проклятых" - относительно результата терапии (успешна/безуспешна) и состояния главного героя (вменяем/невменяем).

Гениально!!! Я когда впервые полтора года назад посмотрел этот фильм, и до сих пор, у меня осталось это чувство неопределенности, подобное как после фильмов Дэвида Линча или того же "Начало"... но я нигде не встречал чтобы кто-нибудь, так как здесь на этом форуме, начал разбирать его.